峄南县委、县政府和运河支队到黄邱套山区与胡大勋、胡大毅等人领导的抗日武装会师后，就积极进行抗日根据地的恢复工作。相继建立了黄邱东区、西区两个区委、区政府和阴平地下区委。黄邱套根据地的恢复和发展，使周围之敌极为不安，他们对黄邱套地区进行接二连三地疯狂扫荡，仅上半年，运河支队等部粉碎了敌伪2000人以上的扫荡就有3次。

    4月25日，国民党五十七军一二二师六八三团纠集土顽李以锦、王洪九等反动武装向抱犊崮山区根据地大举进犯，占领了边联地区，一夜之间袭击驻边联县的中共机关单位22处，活埋、枪杀的干部、群众达77人，这就是发生在鲁南的“四·二五”事件。

    5月，驻周营据点的伪军队长孙晋德带领数10名伪军(枪支)向峄山支队反正投降，受到优待。峄山支队大队长朱玉相叛变投敌，被日军封为驻邹坞的“剿共”司令。峄县支队与边联支队合编，峄县支队番号取消。

    运河支队于1941年初出山后，经朱道南同意，孙斌全的武装力量命名为抗敌自卫军独立团，团长为孙斌全，以黄丘山套为根据地。这支武装力量在伪化严重的峄南起着很大作用，打击了敌人的嚣张气焰，遏制了日伪的蚕食。

    驻周营据点的伪军队长孙晋德带领数10名伪军(枪支)向峄山支队反正投降，受到优待。峄山支队大队长朱玉相叛变投敌，被日军封为驻邹坞的“剿共”司令。接着，峄县支队与边联支队合编，峄县支队番号取消。

    为了在铁道边骚扰和打击敌人，运河支队建立起由12人组成的铁道飞行队，主要任务是在津浦路上韩庄至柳泉之间，从日军过往的火车上截取军用物资装备自己。

    与此同时，担任鲁南军区副司令的孙伯龙，奉命以国民党抗敌自卫军峄山支队名义，在运河南北发展了200人的武装，与运河支队共同战斗在运河南北。

    胡大勋和胡大毅兄弟在主力进山休整时，奉命带领五、八、十三中队在铜东北分散开展活动，当时尽管环境恶劣，条件艰苦，但是由于胡大勋和胡大毅都是本地人，胡大勋又借着和韩治隆的老关系，才得以在铜东北站住脚，不仅把八、十三中队保存下来，同时还进一步说服了韩治隆共同扰日。

    坚持在山区斗争的战士们激动地说：“自从库山战这几个月我们受尽了鬼子、汉奸和国民党顽固派的欺负，你们回来了，要狠狠打击鬼子，惩办汉奸，反击顽固派。”

    当时，峄、滕、铜、邳的斗争形势极其复杂。运河支队回到黄邱山套后，虽然很快在运河南北建立了两个大队和两个游击区政权，并控制了微山岛，但日、伪、顽的力量仍然大于运河支队，想乘运河支队立足未稳之际，进行频繁的扫荡，妄图把运河支队从黄邱山套赶走。

    1941年春，峄县县大队编入运河支队，支队部政工股长曹杰兼第二大队政治教导员并总支书记。曹杰，又名曹德坤，峄县张范村人，1921年出生于农民家庭。他自幼在本村读书。1936年高小毕业，尔后进徐州中学。1938年春，枣庄沦陷，曹杰毅然参加了苏鲁人民抗日义勇总队。不久进岸堤干部学校学习。在校期间参加中国共产党。1939年春，被组织派遣随朱道南到国民党鲁南专员张里元部保安五旅任宣传队长。是年秋，撤出五旅，在峄县县委任青年部长，党外担任峄县青年救国会会长。1940年底，调任县大队政治教导员。运河支队则继续留在铜东北，坚持敌后游击战争，在艰难的处境中开始了新的征程。

    3月，文立正调出运河支队，到鲁南第三军分区任政治部主任。

    鲁南区党委决定成立滕(县)峄(县)边县委，将原属峄县管辖的抱犊崮山区部分划归滕峄边县建制。峄县县委县政府决定，以涧头集为界，恢复和建立了东西两个区政权，要求各区区委着手建立自己的区武装，并在自己的本区域内坚持对敌斗争活动。对部队重新进行了编组：一大队以活动在利国驿以东的新河区一带的五中队为基础。一大队长邵子真，副大队长王默卿带一部分人到津浦铁路沙沟车站以东及铁路两侧隐蔽活动，利用他们自己良好的社会关系，大力发展部队。成立新的二大队：以八中队，十中队为基础，并将五中队的一个分队，县大队合编为九中队，胡大毅任二大队长，曹杰为二大队教导员。派褚雅青回到他的家乡——微山湖东岸的张阿村一带发展部队。

    1941年5月，鲁南区党委决定峄县县委、运河支队，分别划归鲁南第三地委(即沂河地委)第三军分区领导。